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ケニヤです。

スパイウェアってのは
PCの個人情報を外部に送信する機能を持つソフトであり、
ポップアップを表示するものではないはずです。

亀さんの言うポップアップが、
特定のサイトに接続したときに現れる
ポップアップ広告を指しているのなら、
それはスパイウェアの責任ではなく
単にサイトの広告費の問題です。

だいたい、ポップアップなんて表示するソフトの
どこが「スパイ」だっつーんですか。

sleipnirなど、世の中一般に普及しているタブブラウザなら
そういった広告を遮断する機能がありますので、
ポップアップ広告UZEEEEEEEE！と思ったら
そういったブラウザを導入するといいでしょう。

でもまぁ、色々と削除して
PCの挙動が早くなったならいいじゃないですか！
結果オーライですね。